风云一号B星于1990年9月3日成功发射。其性能明显改善，地面收到的可见光云图质量比第一颗气象卫星清晰，红外云图与当时国际先进的同类卫星相当。但风云一号B星上天运行仅仅两个月后，11月初就遭遇了太阳耀斑发射的高能粒子流，发生了单粒子事件，造成姿态控制计算机程序混乱，无法控制卫星姿态，导致卫星在空间翻转。好在这次事件后计算机程序得到了及时的纠正，卫星恢复了正常运行。

1991年2月14日卫星的计算机再一次出现单粒子事件，卫星姿态再次出现异常，这次故障未能及时发现。当发现卫星姿态异常时，卫星上携带的气体已喷完，姿态完全失控，无法拍到云图，本来卫星的设计寿命是要运行一年，但是不到半年卫星就无法工作了。

风云一号卫星主要是为我国气象观测提供一种新手段，利用气象遥感器和空间环境监测器，获取地表和大气层辐射资料，进行海洋遥感技术试验，监测空间环境。风云一号卫星从1977年立项到2002年D星发射，经历了二十多年时间，共研制发射了01批（FY-1A、FY-1B）和02批（FY-1C、FY-1D）共四颗卫。