一、明神宗万历二十一年（公元1593年），淮河流域发生特大洪水。
四月初至八月，淮河流域淫雨不止，七、八月间又发生多次强大的暴雨，洪涝灾害异常严重。据文献资料记载，流域内各支流、干流等地区120多个州县受灾。尤以淮北平原地区灾情最为严重，“平地水深丈余”，“舟行树梢，人栖于木，”“大水进城关市几没。”由于淮河大水，又受黄水顶托，排泄不畅，“高堰决高良涧、周家桥等二十二口，高宝诸堤决口无算”。
据《明实录》记载：“自五月以来大雨倾注，河流漫溢”、“黄淮两河先后决口，黄河决于山东单县黄固口，淮河决于洪泽湖东岸高家埝之高良润、团家桥等二十二口”。汝阳“雨若悬盆，鱼游城关”。新蔡“平地水深数丈，……凡人物房屋冲陷殆尽，无麦无秋禾”。上蔡“春夏淫雨，入秋更甚”。固始“雷雨大作，水漫山腰，人畜随水而下”。阜阳“八月八日水自西北来，奔腾澎湃，顷刻百余里陆地丈许，舟行树梢”。鹿邑“夏五月连雨至九月，麦禾具不登”。凤阳“淮河涨，平地引舟，大水进城”。盱眙“水漫泗州”。宿州“州境半为泽国”。荷泽“五月大雨至八月禾尽没”。曹县“大雨，自四月至八月不止”。曹州府“五月大雨决单县黄固口”。邳州“五月大雨，邳城陷水中。六月，邳州、宿迁溺死人无算”。丰县“夏霖雨三月，人食木皮，次年春，瘟疫大作”。高邮“高宝诸堤决口无算，明年尽塞”。宝应“淮水决高堰，……没田庐人畜，死人无算”。
在全淮河流域大雨，淮河、黄河决口的情况下，从“徐州至扬州间，方数千里，滔天大水，庐舍禾稼荡然无遗”。这是淮河历史上最为严重的一次大水灾。
二、清世宗雍正八年（1730年），沂沭泗水系发生大洪水。
1730年沂沭泗水系6～7月长期淫雨，发生了历史上罕见的大洪水。《莒州志》记载：“夏五月初旬阴雨连绵四十余日。六月十九日大雨如注七昼夜，无一时止息，二十四日洪水横流，东至屋楼，西至浮来，接连四十余里，平地深渊。二十五日冲毁城垣，城门北关只存房屋七间，淹死五六千人。……乡区村庄坟墓骸骨随波而起，沙压良田，沧桑尽变，人畜漂没，不可胜言。”《沂水县志》记载：“六月十九日大风雨，沂水溢，淹田禾庐无算”。“沂沭两河大决于沂水、莒州、临沂、郯城、大溜直注邳（县）、宿迁、苏北一带尽成泽国”。《滕县志》：“大水，米贵如珠，藻满市，人相食”。《定陶县志》：“夏雨连绵，至七月雨如倾盆，遍地皆水，墙垣多坏。（雍正）九年春，民多逃亡”。《山东省历史洪水调查资料》记述：“是年六月十九日暴雨，自江苏赣榆县，经山东省日照、莒县、沂水、临朐，东南西北走向，暴雨中心在沂沭河上游沂蒙山区，历时长，强度大，范围广，灾情重，群众传说至今，在沂河、沭河、弥河、淄河等河道均调查到这次洪水。
据调查估算，这次洪水，沂河在沂水许农湖乡赵家楼洪峰流量为17500立方米每秒，临沂市西朱旺洪峰流量为30000立方米每秒。沭河至临沭县大官庄洪峰流量为15300立方米每秒。是近500年来最大的一次洪水。
三、1921年洪水。
1921年淮河流域由于连续两个月以上的长期降水，形成了全流域的大洪水。该年7月份至9月底，淮河干流长期处于高水位、大流量行洪状态，全流域上、中、下游普遍成灾，沂沭泗洪水灾情也很严重。根据当时淮河流域山东、江苏、河南、安徽四省灾情调查统计资料，农田淹没面积近4973万亩，灾民760余万人，财产损失2.15亿银元。其中以安徽、江苏两省灾情最重。
四、1931年大洪水。
1931年6月下旬至7月底，淮河流域不断出现持续长时间的大雨和暴雨。降水超过500毫米的面积约13万平方公里，其中超过500毫米的面积为5.1万平方公里，超过700毫米的面积为1.3万平方公里。淮河干流6月下旬开始涨水，7月底、8月初相继出现最高洪水位。当年里运河开启归海坝3处，东西堤溃口80多处，里下河地区尽为泽国。
1931年淮河流域灾情极为严重。边及流域内河南、安徽、江苏、山东四省100多个县。据统计，全流域淹没农田7700余万亩，受灾人口2100多万，死亡人数75000多人。灾后瘟疫流行，急性传染病蔓延城乡，仅江苏省高邮县统计死于瘟疫的就有数千人。经济损失高达5.64亿银圆。
五、1938年黄河花园口扒口。
1938年日军占领徐州继续西侵。国民党政府企图阻止日军前进，于6月2日和6日，先后在黄河赵口和花园口扒开黄河南堤。赵口汛后淤塞，但花园口至11月12日口门冲宽400余米。花园口决口历时9年，至1947年3月堵口才完工。
据1938年当年统计，淮河流域受灾面积共5.4万平方公里。灾情较重的44县（市），其中河南20县，安徽18县，江苏6县。许多县淹地1米以上。共有391万多人外逃，90万人死亡，死亡人数占原有人口的4.6%，经济损失达10.92亿银圆。
六、1954年全流域洪水。
1954年淮河洪水为江淮梅雨所造成。当年5月中旬发生一次较大暴雨，暴雨中心地区雨量达300～350毫米，6月暴雨中心雨量400～500毫米，中心位置在淮南、史淠河上游。7月份，流域内有5次降雨过程，流域内面平均雨量513毫米，为多年同期平均雨量的3～5倍。700毫米以上的雨区范围约4万平方公里。
1954年淮河洪水造成严重的洪涝灾害，河南省合计85县市受灾，其中淮滨县几乎全县淹没，淹农田1342万亩，倒房30万间。安徽省2620万亩农田受淹，倒房168万间，死亡1098人，死畜1052头。江苏省淹没农田1063万亩，死亡832人。淮河下游里下河地区连续暴雨各河水位猛涨，内涝严重。
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