福州市气象局成立于1983年10月，是中央直属正处级垂直管理单位，实行上级气象主管机构与本级人民政府双重领导，以上级气象主管机构领导为主的管理体制。
全市气象部门人员编制141名，市局本部53名。目前，市局在职干部职工42人，在职党员27人。
内设办公室（计划财务处）、业务科技处、人事教育处（监察审计处、精神文明建设办公室）、政策法规处(福州市防雷办公室)等4个职能处（室）。设福州市气象台（福州市海洋气象台）、福州市气象科技服务中心（福州市专业气象台）、福州市防雷中心、福州农业气象试验站（晋安区气象局）4个直属单位。闽侯县气象局、长乐市气象局、福清市气象局、平潭县气象局、连江县气象局、罗源县气象局、永泰县气象局、闽清县气象局等8个县（市）级气象局。
