巢湖市气象局的前身——原巢县忠庙气象站，建于1955年。巢湖行政公署1965年建制同时迁移至巢县北门，建制巢湖行政公署气象台。1974年升格巢湖行署气象局，2000年地级巢湖市成立更名市气象局。市局所辖四县一区气象局，实行双重领导和双重计划财务体制，职工数为88人。在原地委行署（市委市政府）和省气象局的领导下，40多年来，气象事业从弱到强，在大气探测、天气预报、气象为国防服务等方面积累了大量资料和经验。改革开放给气象事业带来新的活力。以实现气象科技现代化为核心，完成了通讯卫星接收系统、卫星云图接收、X.25专线、711雷达数据化改造等工程，建成了现代化业务平面和一支高科技队伍。开辟了防雷减灾、人工增雨、安徽农网“信息入乡”等巢湖地方气象事业；以现代化业务为基础，拓展“12121”天气预报自动答询电话、气象影视、广播报纸气象专栏、防雷安全、庆典和水运气象导航等服务项目。坚持气象为地方经济建设服务为中心，积极主动为市委市政府防汛抗旱决策服务，做到气象决策服务早，跟踪服务及时。对可能出现“三性”天气，及时发布预测公告，做到决策服务领导满意，公益服务社会满意，专业服务用户满意。
巢湖市气象局对1979年丰梅、1980年洪涝、1982年大暴雨、1983年大水、1984年异常雪灾、1986年和1987年丰梅、1988年大旱、1989年13号台风、1990年干旱、1991年大水、1994年和1997年干旱、1998年1999年大水、2000年2001年大旱、2008年低温冰冻雨雪和“凤凰”台风，都基本做到了“准确及时、优质高效”服务，社会经济效益显著。多次荣获省委省政府、国家气象局、市委市政府、省气象局颁发的“先进集体”称号。还荣获安徽省第五届、第六届、第七届、第八届省级“文明单位”，2004-2006年省文行委授予“安徽省创建文明行业先进单位”，2008年“安徽省卫生先进单位”，1997—2008年市级“文明单位”。
